Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.2 ms