Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpa33Q9JKA5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpa33Q9JKA5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpa33Q9JKA5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpa33Q9JKA5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms