Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms