Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms