Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms