Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms