Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms