Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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