Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Lrrn2Q6PHP6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Lrrn2Q6PHP6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn2Q6PHP6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms