Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms