Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2surpQ6NV83 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms