Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 357.7 ms