Protein–RNA interactions for Protein: Q5UAK0

Mier1, Mesoderm induction early response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier1Q5UAK0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mier1Q5UAK0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mier1Q5UAK0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mier1Q5UAK0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mier1Q5UAK0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mier1Q5UAK0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms