Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.7 ms