Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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