Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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