Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms