Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tmod1P49813 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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