Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms