Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms