Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnga1P29974 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms