Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm3P21107 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm3P21107 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm3P21107 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm3P21107 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3P21107 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3P21107 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms