Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prf1P10820 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prf1P10820 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms