Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR5

Tdpoz1, TD and POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdpoz1P0DMR5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tdpoz1P0DMR5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdpoz1P0DMR5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms