Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01664 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01664 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01664 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01664 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01664 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01664 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P01664 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01664 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01664 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01664 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01664 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01664 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01664 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01664 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01664 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01664 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01664 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01664 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01664 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01664 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01664 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01664 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01664 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01664 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01664 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01664 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01664 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01664 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01664 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01664 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms