Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2f6O54917 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2f6O54917 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2f6O54917 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2f6O54917 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms