Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rabep1O35551 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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