Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Smad7O35253 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms