Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
6030445D17RikE9Q8F9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms