Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20425E9Q035 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20425E9Q035 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms