Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d2A3KG59 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms