Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms