Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms