Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgn5Q9JL35 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms