Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Cldn19Q9ET38 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cldn19Q9ET38 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Cldn19Q9ET38 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Cldn19Q9ET38 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn19Q9ET38 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn19Q9ET38 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn19Q9ET38 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn19Q9ET38 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn19Q9ET38 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Cldn19Q9ET38 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn19Q9ET38 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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