Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms