Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx12Q9ER00 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms