Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms