Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Spns3Q9D232 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spns3Q9D232 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spns3Q9D232 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms