Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gps1Q99LD4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms