Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pdcl3Q8BVF2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl3Q8BVF2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms