Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms