Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med16Q6PGF3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms