Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms