Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctf1Q60753 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms