Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TchpQ3TVW5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms