Protein–RNA interactions for Protein: Q14B02

Rnf133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf133Q14B02 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf133Q14B02 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf133Q14B02 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf133Q14B02 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf133Q14B02 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf133Q14B02 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Rnf133Q14B02 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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Rnf133Q14B02 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf133Q14B02 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf133Q14B02 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf133Q14B02 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf133Q14B02 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf133Q14B02 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf133Q14B02 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf133Q14B02 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf133Q14B02 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf133Q14B02 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf133Q14B02 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms