Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha4Q03137 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms