Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bop1P97452 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms