Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd1P52734 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms